Carta aliran bakteria memberikan bantuan visual untuk mengenal pasti spesies bakteria yang cepat. Untuk membuat carta alir, mengenal pasti ciri-ciri umum kumpulan bakterinya yang berbeza terlebih dahulu untuk mengecualikan kumpulan yang tidak berkaitan, dan untuk lebih cekap menentukan bakteria yang ada sekarang. Pelbagai perisian mempunyai elemen geometri yang diperlukan untuk menangani satu kumpulan pada satu masa, oleh Gram noda dan bentuk. Spesies bakteria kulit yang biasa, Staphylococcus aureus, menawarkan tempat yang sangat baik untuk bermula, dengan setiap langkah dalam alur alur ditetapkan dalam bentuk geometri seperti persegi panjang, bujur, persegi atau kotak dengan garis yang menghubungkan setiap langkah seterusnya di bawah untuk carta aliran sejajar potret dan mendatar untuk carta berorientasikan lanskap.
Tentukan budaya yang akan diuji adalah budaya tulen. Juga mengenalpasti asal-usul sampel untuk menyempitkan jajaran carta aliran.
Tulis atau taip "Gram Stain" sebagai ujian utama dan buat dua cabang dari kotak ini. Tandai cabang "Gram Positif" dan "Gram Negatif." Gram positif, seperti Staphylococcus, kelihatan noda dan noda Gram-negatif, seperti E. coli kelihatan merah. Bakteria dibahagikan kepada dua kumpulan ini dan pewarnaan Gram adalah ujian pertama yang dilakukan pada sampel yang tidak diketahui, kerana ia adalah prosedur mudah dan murah yang membolehkan peratusan besar kemungkinan dibuang.
Masukkan pilihan seterusnya dalam kotak atau bentuk lain pada carta alir, yang mengenal pasti bentuk bakteria yang diperolehi daripada analisis mikroskopik dari noda Gram. Jenis-jenis bentuk adalah rod, cocci, bola atau lingkaran, spirillia, rod berputar spiral, spirochetes, rod panjang berpintal spiral yang sangat nipis, dengan tunas dan lampiran dan bahagian-bahagian yang berbentuk benang. Batang dan cocci adalah yang paling biasa. Staphylococcus mengenal pasti sebagai coccus.
Berpisah dengan langkah, kotak atau bentuk pilihan yang lain, ke dalam ujian biokimia untuk setiap cabang carta alir. Ini berbeza untuk pelbagai bentuk kumpulan Gram. Ujian utama untuk cocci Gram-positif adalah ujian katalase menggunakan hidrogen peroksida, dan pilihan hasilnya sama ada negatif katalase atau negatif katalase. Sebagai contoh, ujian Mikrokoccus dan Staphylococcus menguji positif dan ujian Streptococcus negatif. Contoh-contoh langkah-langkah lain untuk kumpulan di luar positif non-cocci, bukan Gram termasuk penapaian laktosa atau bukan penapaian untuk rod negatif Gram.
Menganalisis sifat penapaian bakteria pada elemen seterusnya dalam carta alir. Bakteria sama ada mengolah atau mengoksidasi. Staphylococcus aureus adalah fermentatif berbanding dengan Micrococcus, yang merupakan oksidatif.
Analisis penapaian adalah langkah yang sama untuk pengenalan bakteria Gram-positif dan Gram-negatif.
Tambah garisan dan bentuk lain ke carta alir. Langkah ini mewakili ujian untuk pembekuan, ujian biokimia yang dipanggil koagulase. Staphylococcus aureus menghasilkan enzim koagulase, dan apabila diuji dengan medium yang sesuai, menghasilkan gumpalan seperti jelly. Semua ujian staphylococci yang lain sebagai koagulan negatif.
Langkah-langkah alternatif untuk kumpulan bakteria lain termasuk ujian oksidase untuk rod Gram-negatif, atau penapaian laktosa yang cepat atau lambat.