Kandungan
- Sekatan Enzim dan Sekatan
- Orientasi yang betul
- Ligating Sticky Ends Membutuhkan DNA Kurang
- Enzim-enzim Yang Berbeza Boleh Memberikan End Sticky Yang Sama
Pengklonan molekul adalah kaedah bioteknologi yang biasa yang perlu diketahui setiap pelajar dan penyelidik. Pengklonan molekul menggunakan sejenis enzim yang dipanggil enzim sekatan untuk memotong DNA manusia menjadi serpihan yang kemudiannya dimasukkan ke dalam DNA plasmid sel bakteria. Enzim sekatan mengurangkan kedua-dua DNA terkandas pada separuh. Bergantung pada enzim sekatan, potongan boleh menyebabkan sama ada akhir melekit atau akhir tumpul. Hujung melekit lebih berguna dalam pengklonan molekul kerana mereka memastikan bahawa fragmen DNA manusia dimasukkan ke dalam plasmid ke arah yang betul. Proses ligation, atau penyebaran serpihan DNA, memerlukan sedikit DNA apabila DNA mempunyai ujung lengket. Akhir sekali, pelbagai enzim sekatan akhir yang melekat boleh menghasilkan ujung lengket yang sama, walaupun setiap enzim mengenal pasti urutan sekatan yang berlainan. Ini meningkatkan kemungkinan bahawa rantau DNA minat anda dapat dipotong oleh enzim akhir lengket.
Sekatan Enzim dan Sekatan
Enzim sekatan adalah enzim yang memotong mengiktiraf urutan spesifik pada DNA double-stranded dan memotong DNA pada separuh pada urutan itu. Urutan yang diiktiraf dipanggil tapak sekatan. Enzim sekatan dipanggil endonukleases kerana mereka memotong DNA dua stranded, iaitu bagaimana DNA biasanya wujud, di lokasi yang berada di antara hujung DNA. Terdapat lebih daripada 90 enzim sekatan yang berlainan. Setiap mengiktiraf tapak sekatan yang berbeza. Enzim sekatan mengekalkan tapak sekatan masing-masing sebanyak 5,000 kali lebih cekap daripada tapak lain yang tidak dikenali.
Orientasi yang betul
Enzim sekatan datang dalam dua kelas umum. Mereka sama ada memotong DNA ke hujung melekat atau hujung tumpul. Akhir melekat mempunyai rantau nukleotida yang pendek, blok bangunan DNA, yang tidak berpasangan. Kawasan yang tidak berpasangan ini dipanggil tidak terjual. Yang tidak terjual dikatakan lengket kerana ia mahu dan akan dipasangkan dengan satu lagi lengket yang melengkapkan urutan yang tidak lengkap. Hujung yang melekit adalah seperti kembar yang hilang lama yang ingin memeluk satu sama lain apabila mereka bertemu. Sebaliknya, hujung tumpul tidak lengket kerana semua nukleotida telah dipasangkan di antara dua helai DNA. Kelebihan hujung melekat adalah bahawa fragmen DNA manusia hanya boleh masuk ke dalam plasmid bakteria dalam satu arah. Sebaliknya, jika kedua-dua DNA manusia dan plasmid bakteria mempunyai hujung tumpul, DNA manusia boleh dimasukkan ke kepala ke ekor atau ekor ke plasmid.
Ligating Sticky Ends Membutuhkan DNA Kurang
Walaupun DNA dengan tungkai kayu mempunyai masa yang lebih mudah mencari antara satu sama lain kerana "kelenturan" mereka, tidak ada hujung yang melekit atau hujung tumpul yang boleh bersatu menjadi sekeping DNA yang berterusan. Pembentukan sekeping DNA yang berterusan yang berkaitan sepenuhnya memerlukan enzim yang dipanggil ligase. Ligase menyambung tulang belakang nukleotida pada hujung melekat atau tumpul, menyebabkan rantaian nukleotida berterusan. Oleh kerana hujung melekit saling mencari antara satu sama lain dengan lebih pantas kerana tarikan mereka satu sama lain, proses ligation memerlukan kurang DNA manusia dan DNA plasmid yang kurang. Hujung tumpul DNA dan plasmid kurang cenderung untuk mencari antara satu sama lain, dan oleh itu ligation berakhir tumpul memerlukan lebih banyak DNA dimasukkan ke dalam tiub ujian.
Enzim-enzim Yang Berbeza Boleh Memberikan End Sticky Yang Sama
Laman sekatan terletak di seluruh genom organisma, tetapi tidak sama rata. Dalam plasmids, mereka boleh direkabentuk untuk berada berdekatan dengan satu sama lain. Para saintis yang ingin memotong serpihan DNA manusia dari genom manusia mesti mencari tapak sekatan yang berada di depan dan di belakang kawasan serpihan. Di samping memastikan bahawa fragmen DNA dimasukkan ke arah yang betul, enzim akhir lengket berlainan boleh mencipta akhir melekat yang sama walaupun mereka mengenali urutan sekatan yang berbeza. Sebagai contoh, BamHI, BglII, dan Sau3A mempunyai urutan pengecaman yang berbeza tetapi menghasilkan akhir yang melekat GATC yang sama. Ini meningkatkan kemungkinan bahawa akan terdapat laman web sekatan akhir yang melekatkan minat minat manusia anda.